BRD3 属于溴结构域(BRD)家族 II(BET 家族)。与其他 BRD 家族蛋白一样,它可与乙酰化赖氨酸结合,充当组蛋白等蛋白质赖氨酸乙酰化状态的 “阅读器”。作为一种转录调节因子,它通过 E2F-RB 通路参与许多细胞过程(胚胎发生、周期调控、发育)。BRD3 与 GATA 转录因子相互作用,以实现其染色质占据并调控多种癌基因(如 c-MYC)。
因此,抑制 BRD3 的功能已成为癌症治疗策略的一部分。最近,通过 PROTAC 分子靶向包括 BRD3 在内的 BET 家族蛋白降解,已成为一种新颖且极具前景的治疗方法。
HTRF 总 BRD3 检测用于定量细胞裂解物中 BRD3 的表达水平。与蛋白质印迹法不同,该检测完全基于微孔板进行,无需凝胶、电泳或转膜步骤。总 BRD3 检测使用两种标记抗体:一种偶联供体荧光团,另一种偶联受体荧光团。两种抗体均对该蛋白上的特定表位具有高度特异性。当细胞提取物中存在 BRD3 时,加入这些偶联物会使供体荧光团与受体荧光团靠近,从而产生 FRET 信号。信号强度与样品中该蛋白的浓度直接成正比,并在免洗涤的检测格式下为评估蛋白表达水平提供了手段。
HTRF 总 BRD3 检测原理
双板方案包括:先在 96 孔板中培养细胞,然后裂解细胞,再将裂解物转移至 384 孔低体积检测板,之后加入总 BRD3 HTRF 检测试剂。该方案能够监测细胞的活力和汇合度。
HTRF 总 BRD3 检测双板方案
使用 HTRF 试剂检测总 BRD3 可在单个培养板中完成,该培养板同时用于细胞培养、刺激和裂解,无需洗涤步骤。这种为高通量筛选(HTS)设计的方案可实现小型化操作,同时保持稳定的 HTRF 检测质量。
HTRF 总 BRD3 检测单板方案
将贴壁人细胞系 MCF7(乳腺)、HEK293(胚胎肾)和 HeLa(宫颈)以 100,000 个细胞 / 孔的密度接种到 96 孔培养板中,在 37°C、5% CO₂条件下孵育 24 小时。移除培养基后,用 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)裂解细胞。
使用 HTRF 总 BRD3 试剂盒评估 BRD3 的表达水平。简要步骤为:将 16µL 细胞裂解物转移至低体积白色微孔板中,然后加入 4µL 预混合的 HTRF 检测试剂。室温过夜孵育后记录 HTRF 信号。虚线对应非特异性 HTRF 信号。值得注意的是,预先对细胞密度进行了优化,以确保 HTRF 检测处于试剂盒的动态范围内(数据未显示)。
HTRF 总 BRD3 检测能有效检测多种表达不同水平该蛋白的细胞模型中的 BRD3。
总 BRD3 检测在多种细胞系上的验证
总 BRD3 检测的药理学验证 ——HeLa 细胞上的 PROTAC
PROTAC® | 所述 POI | 弹头 | E3L 配体 | 已公布效力 | DC50 |
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dBET6 | BET 家族 | JQ1 衍生物 | 沙利度胺(脑啡肽配体) | 14-50 nM | 67 nM |
ARV-771 | BET 家族 | JQ1 衍生物 | VHL-1(VHL 配体) | 8-34 nM | 33 nM |
MZP-54 | BET 家族 | I-BET726 | VH032(VHL 配体) | 50-300 nM | 22 nM |
dBRD9 | BRD9 选择性 | BI7273 | 泊马度胺(脑啡肽配体) | 非靶向 BRD3 | 无降解 |
ARV-471 | ERα | 与 BRD2 靶标无关 |
|
| 无降解 |
使用 HTRF 总 BRD3 试剂盒评估 HAP1 细胞(野生型)和五种不同的 HAP1 敲除细胞系(分别敲除 BRD2、BRD4(BET 家族)、BRD7 或 BRD9(家族 IV))中 BRD3 的表达水平。预先对细胞密度进行了优化,以确保 HTRF 检测处于试剂盒的动态范围内(数据未显示)。
将这 6 种不同的细胞系在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。移除培养基后,用 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)裂解细胞,将 16µL 细胞裂解物转移至低体积白色微孔板中,然后加入 4µL 预混合的检测试剂。室温过夜孵育后记录 HTRF 信号。
在 HAP1 BRD3 敲除细胞中,HTRF 信号与非特异性信号(虚线)相当,表明 BRD3 基因被完全沉默,而正如预期的那样,在其他细胞系中可很好地检测到 BRD3 水平。
值得注意的是:i)与野生型 HAP1 细胞相比,在 BRD2、BRD4、BRD7 和 BRD9 敲除细胞系中未检测到 BRD3 水平的降低,这表明 HTRF BRD3 试剂盒相对于 BRD2、BRD4、BRD7 和 BRD9 具有选择性;ii)在 HAP1 BRD2 敲除细胞和 HAP1 BRD4 敲除细胞中,BRD2 和 BRD4 的表达水平显著高于野生型 HAP1 细胞,这提示存在代偿机制。
使用敲除 HAP1 细胞系验证总 BRD3 检测的特异性
将 HeLa 细胞在 T175 培养瓶中的完全培养基中于 37°C、5% CO₂条件下培养。孵育 48 小时后,移除细胞培养基,用 3mL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)在室温下轻轻振荡 30 分钟裂解细胞。
使用补充的 4 号裂解缓冲液对细胞裂解物进行系列稀释,将 16µL 每种稀释液转移至低体积白色微孔板中,然后加入 4µL HTRF 总 BRD3 检测试剂。
使用等量的裂解物进行 HTRF 与蛋白质印迹法的平行比较。
在这些实验条件下,HTRF 总 BRD3 检测的灵敏度是蛋白质印迹法的 2 倍。
HTRF 总 BRD3 检测与蛋白质印迹法的比较
BRD3 信号通路
BRD3 与超乙酰化染色质区域(也称为超级增强子区域)结合,并在转录调控中发挥作用。它在染色质上提供一个支架,用于招募 E2F 蛋白等进行染色质重塑。当转录因子 GATA1 被 CREB 结合蛋白(CRB)乙酰化后,BRD3 也会被其招募,以激活和抑制靶基因并促进其染色质占据。
HTRF 总 BRD3 检测信号通路
- 应用:细胞信号传导
- 兼容自动化:是
- 品牌:HTRF
- 检测方式:HTRF
- 兼容的裂解缓冲液:1 号裂解缓冲液、2 号裂解缓冲液、3 号裂解缓冲液、4 号裂解缓冲液
- 分子修饰:总量
- 产品类别:试剂盒
- 样品体积:16µL
- 运输条件:干冰运输
- 靶标类别:磷蛋白
- 靶标物种:人
- 技术:时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)
- 治疗领域:肿瘤学与炎症
- 单位规格:500 个检测点