BRD9(含 BRD9 溴域蛋白 9)是溴域蛋白家族 IV 的成员,该家族还包括 BRD7。BRD9 是 SWI/SNF(GBAF 或 ncBAF)复合体的一个亚基,可结合组蛋白的乙酰化赖氨酸残基,介导染色质重塑和转录调控。BRD9 参与多能性调控和细胞发育过程。
BRD9 的过表达与神经发育障碍以及急性髓系白血病等癌症相关。近年来,通过 PROTAC 分子靶向降解 BRD9 已成为一种新颖且具有前景的治疗方法。然而,BRD9 和 BRD7 蛋白具有 72% 的残基相似性,因此化合物可能同时靶向原癌基因 BRD9 和抑癌基因 BRD7。因此,必须仔细研究靶向 BRD9 或 BRD7 的化合物的选择性。为此,HTRF 总 BRD7 检测试剂盒是 HTRF 总 BRD9 检测试剂盒的重要配套检测工具,可实现可靠的化合物谱分析。
HTRF 总 BRD9 检测可定量细胞裂解物中 BRD9 的表达水平。与蛋白质印迹法不同,该检测完全基于微孔板,不需要凝胶、电泳或转膜步骤。总 BRD9 检测使用两种标记抗体:一种偶联供体荧光团,另一种偶联受体荧光团。两种抗体都对蛋白质上的不同表位具有高度特异性。当细胞提取物中存在 BRD9 时,添加这些偶联物会使供体荧光团与受体荧光团接近,从而产生 FRET 信号。其强度与样品中蛋白质的浓度直接成正比,并提供了一种在无需洗涤的检测形式下评估蛋白质表达的方法。
双板方案包括在 96 孔板中培养细胞,然后裂解,接着将裂解物转移到 384 孔小体积检测板中,再添加总 BRD9 HTRF 检测试剂。该方案能够监测细胞的活力和汇合度。
使用 HTRF 试剂检测总 BRD9 可在单个用于培养、刺激和裂解的板中进行。无需洗涤步骤。这种高通量筛选设计的方案能够实现微型化,同时保持稳定的 HTRF 质量。
将贴壁的人细胞系 MCF7 和 MDA-MB-543 细胞(乳腺)、HELA 细胞(宫颈)、SH-SY5Y 细胞(骨髓神经母细胞瘤)以及小鼠细胞系 NIH3T3 和 Neuro2A 以 100,000 个细胞 / 孔的密度接种在 96 孔培养板中,在 37°C、5% CO₂条件下孵育 24 小时。去除培养基后,用 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)裂解细胞。
将悬浮的人免疫 PL-21 细胞系(急性髓系白血病)以 30µL 的量分配到 96 孔板中,密度为 100,000 个细胞 / 孔,在 37°C、5% CO₂条件下孵育 1 小时,然后用 10µL 补充的 4 号裂解缓冲液(4X)裂解。
使用 HTRF 总 BRD9 试剂盒评估 BRD9 的表达水平。简要来说,将 16µL 细胞裂解物转移到小体积白色微孔板中,然后加入 4µL 预混合的 HTRF 检测试剂。在室温下孵育过夜后记录 HTRF 信号。虚线对应非特异性 HTRF 信号。请注意,之前已对细胞密度进行了优化,以确保在试剂盒的动态范围内进行 HTRF 检测(数据未显示)。
HTRF 总 BRD9 检测能有效检测各种表达不同水平该蛋白的细胞模型中的 BRD9。
MCF7 和 HeLa 细胞在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。去除细胞培养基后,用递增浓度的 PROTAC 化合物 dBRD9 和 VZ185 以及作为阴性无关对照的 PROTAC ARV-471(PROTAC 雌激素受体)处理细胞。过夜孵育后,去除细胞培养基,向每个孔中加入 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)。细胞裂解后,将 16µL 裂解物转移到 384 孔小体积白色微孔板中,并加入 4µL HTRF BRD9 检测抗体。过夜孵育后记录 HTRF 信号。
在两种细胞类型中,两种 BRD9 PROTAC 降解剂均触发 BRD9 蛋白的剂量依赖性减少,而在 ARV-471 对照条件下 BRD9 的表达水平以及 GAPDH 均保持稳定。这些结果表明 PROTAC 诱导了特异性的 BRD9 降解,DC50 * 在 nM 范围内,与预期一致(Remillard 等人,《德国应用化学国际版》,2017 年;Zoppi 等人,《药物化学杂志》,2019 年)。
DC50 对应于使 50% 的靶蛋白降解的降解剂浓度。
由于 BRD9 是一种癌基因,而 BRD7 起着肿瘤抑制因子的作用,因此选择性降解 BRD9 而非 BRD7 具有重要意义。
HeLa 细胞在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。去除细胞培养基后,用递增浓度的 dBRD9 和 VZ185 PROTAC 化合物处理细胞。过夜处理后,去除细胞培养基,向每个孔中加入 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)。细胞裂解后,将 16µL 裂解物转移到 384 孔小体积白色微孔板中,并加入 4µL HTRF 检测抗体,使用总 BRD9 或总 BRD7 检测试剂。过夜孵育后记录 HTRF 信号。
这些结果表明,VZ185 诱导 BRD9 和 BRD7 的剂量依赖性减少,而 dBRD9 仅诱导 BRD9 的剂量依赖性减少。在相同条件下,GAPDH 保持稳定(数据未显示)。这一结果证实了 dBRD9 介导的选择性 BRD9 降解,如 Remillard 等人(《德国应用化学国际版》,2017 年)和 Zoppi 等人(《药物化学杂志》,2019 年)所描述的。
使用 HTRF 总 BRD9 试剂盒评估 HAP1 细胞(野生型)和五种敲除了 BRD9、BRD7(家族 IV)、BRD2、BRD3 或 BRD4(BET 家族)的不同 HAP1 细胞系中的 BRD9 表达水平。之前已对细胞密度进行了优化,以确保在试剂盒的动态范围内进行 HTRF 检测(数据未显示)。
将 6 种不同的细胞系在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。去除培养基后,用 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)裂解细胞,然后将 16µL 细胞裂解物转移到小体积白色微孔板中,接着加入 4µL 预混合的检测试剂。在室温下过夜孵育后记录 HTRF 信号。
在 HAP1 BRD9 敲除细胞中,HTRF 信号与非特异性信号(虚线)相当,表明 BRD9 基因完全沉默,而正如预期的那样,在其他细胞系中能很好地检测到 BRD9 水平。
请注意:i)在 HAP1 BRD3 敲除细胞系中,BRD9 表达水平显著更高,表明存在补偿机制;ii)野生型和 BRD7 敲除细胞系中 BRD9 的表达水平相似,这表明 HTRF BRD9 试剂盒对 BRD7 具有选择性,因为这两种蛋白质共享超过 50% 的序列同源性。
目录细胞系参考(Horizon Discovery):HAP1 野生型 #C631;HAP1 BRD9 敲除 #HZGHC000934c003;HAP1 BRD7 敲除 #HZGHC000923c010;HAP1 BRD2 敲除 #HZGHC000356c015;HAP1 BRD3 敲除 #HZGHC000244c004;HAP1 BRD4 敲除 #HZGHC000937c007。
MCF7 细胞在 T175 培养瓶中的完全培养基中于 37°C、5% CO₂条件下培养。孵育 48 小时后,去除细胞培养基,用 3mL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)裂解细胞,在室温下轻轻摇晃 30 分钟。
使用补充的 4 号裂解缓冲液对细胞裂解物进行系列稀释,将 16µL 每种稀释液转移到小体积白色微孔板中,然后加入 4µL HTRF 总 BRD9 检测试剂。
使用等量的裂解物进行 HTRF 和蛋白质印迹法的平行比较。
在这些条件下,HTRF 总 BRD9 检测的灵敏度是蛋白质印迹技术的 8 倍。
MCF7 细胞在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。去除细胞培养基后,用递增浓度的 dBRD9 处理细胞。过夜处理后,去除细胞培养基,向每个孔中加入 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)。使用 16µL 相同的细胞裂解物,按照各自的方案进行总 HTRF BRD9 检测和蛋白质印迹检测。
两种技术均显示 dBRD9 诱导 BRD9 的剂量依赖性减少,且 DC50 具有相关性(HTRF 为 40nM,蛋白质印迹法为 90nM),而 GAPDH 的表达水平保持稳定(数据未显示)。
MCF7 细胞在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。去除细胞培养基后,用递增浓度的 dBRD9 处理细胞。过夜处理后,去除细胞培养基,向每个孔中加入 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)。使用 16µL 相同的细胞裂解物,按照各自的方案进行总 HTRF BRD9 检测和蛋白质印迹检测。
两种技术均显示 dBRD9 诱导 BRD9 的剂量依赖性减少,且 DC50 具有相关性,而 GAPDH 的表达水平保持稳定(数据未显示)。
BRD9 是一种 GBAF(或 ncBAF)重塑复合体亚基,与 GLTSCR1/1L 蛋白特异性相关。BRD9 结合乙酰化的组蛋白,导致染色质重塑和基因转录调控,如 cMyc(凋亡调节因子)和 SOCS3(STAT5 通路调节因子)(1,2)。
最近的研究表明,BRD9 的表达受 KRAS 和 PI3K 通路调控(2)。BRD4 以溴域依赖的方式介导 GBAF 复合体亚基向染色质的募集(1,3)。
此外,已有报道称 BRD9 作为转录激活因子在干扰素刺激基因(ISGs)的 IRF9 依赖性表达中发挥关键作用,这也涉及 STAT2 和 STAT1 蛋白(4)。
(1):Innis 等人,《表观遗传学与染色质》,2020 年
(2):Zhu 等人,《肿瘤靶点与治疗》,2020 年
(3):Gatchalian 等人,2018 年
(4):Borold 等人,《欧洲分子生物学组织报告》,2021 年
其他规格 | 详情 |
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应用 | 细胞信号传导 |
兼容自动化 | 是 |
品牌 | HTRF |
检测方式 | HTRF |
裂解缓冲液兼容性 | 1 号裂解缓冲液、2 号裂解缓冲液、3 号裂解缓冲液、4 号裂解缓冲液 |
分子修饰 | 总量 |
产品类别 | 试剂盒 |
样品体积 | 16µL |
运输条件 | 干冰运输 |
靶标类别 | 磷蛋白 |
靶标物种 | 人、小鼠 |
技术 | 时间分辨荧光共振能量转移 |
治疗领域 | 肿瘤学与炎症 |
单位规格 | 500 个检测点 |