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arial, helvetica, sans-serif; font-size: 16px;">总 BRD7 检测的药理学验证 ——HELA 细胞上的 PROTAC


总 BRD7 检测的药理学验证 ——HELA 细胞上的 GAPDH


将 MCF7 和 HeLa 细胞在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。移除细胞培养基后,用浓度递增的 PROTAC 化合物 dBRD9 和 VZ185 处理细胞,同时使用 PROTAC ARV-471(PROTAC 雌激素受体)作为无关阴性对照。过夜孵育后,移除细胞培养基,向每个孔中加入 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)。细胞裂解后,将 16µL 裂解物转移至 384 孔小体积白色微孔板中,并加入 4µL HTRF BRD7 检测抗体。过夜孵育后记录 HTRF 信号。


在这两种细胞中,只有 VZ185 降解剂可引发 BRD7 蛋白的剂量依赖性减少,而在 BRD9 选择性 PROTAC(dBRD9)和 ARV-471 对照条件下,BRD7 的表达水平未受影响。注意,与经 ARV-471 处理的 MCF7 细胞不同,HeLa 细胞中的 GAPDH 保持稳定。


这些结果表明 VZ185 PROTAC 可诱导 BRD7 降解,其 DC50 在纳摩尔范围内,正如 Zoppi 等人(《药物化学杂志》,2019 年)所报道的那样。


DC50 指降解剂使 50% 的靶蛋白发生降解时的浓度。

PROTAC 对 BRD9 和 BRD7 的谱分析

BRD9 与 BRD7 的谱分析 —— 总 BRD9 检测


BRD9 与 BRD7 的谱分析 —— 总 BRD7 检测


由于 BRD9 是一种癌基因,而 BRD7 具有肿瘤抑制作用,因此选择性降解 BRD9 而非 BRD7 至关重要。


将 HeLa 细胞在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。移除细胞培养基后,用浓度递增的 dBRD9 和 VZ185 PROTAC 化合物处理细胞。过夜处理后,移除细胞培养基,向每个孔中加入 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)。细胞裂解后,将 16µL 裂解物转移至 384 孔小体积白色微孔板中,并使用总 BRD9 或总 BRD7 检测试剂加入 4µL HTRF 检测抗体。过夜孵育后记录 HTRF 信号。


这些结果表明,VZ185 可诱导 BRD9 和 BRD7 的剂量依赖性减少,而 dBRD9 仅诱导 BRD9 的剂量依赖性减少。在相同条件下,GAPDH 保持稳定(数据未显示)。这一结果证实了 dBRD9 可介导 BRD9 的选择性降解,正如 Remillard 等人(《德国应用化学国际版》,2017 年)和 Zoppi 等人(《药物化学杂志》,2019 年)所描述的那样。

使用敲除 HAP1 细胞系验证 HTRF 总 BRD7 检测的特异性

使用 HTRF 总 BRD7 试剂盒评估 HAP1 细胞(野生型)和五种不同的 HAP1 敲除细胞系(分别敲除 BRD9、BRD7(IV 类)、BRD2、BRD3 或 BRD4(BET 家族))中 BRD7 的表达水平。此前已对细胞密度进行优化,以确保 HTRF 检测处于试剂盒的动态范围内(数据未显示)。


将 6 种不同的细胞系在 96 孔板中(50,000 个细胞 / 孔)于 37°C、5% CO₂条件下培养 24 小时。移除培养基后,用 50µL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)裂解细胞,然后将 16µL 细胞裂解物转移至小体积白色微孔板中,再加入 4µL 预混合的检测试剂。室温过夜孵育后记录 HTRF 信号。


在 HAP1 BRD7 敲除细胞中,HTRF 信号与非特异性信号(虚线)相当,表明 BRD7 基因完全沉默;而正如预期,在其他细胞系中可很好地检测到 BRD7 水平。这一结果证明了 HTRF BRD7 试剂盒对 BRD9 的选择性,尽管这两种蛋白质有超过 50% 的序列同源性。


注意,与野生型细胞系相比,HAP1 BRDs 敲除细胞系中 BRD7 的表达水平显著更高,这可能表明存在代偿机制。


目录细胞系参考(Horizon Discovery):HAP1 野生型 #C631;HAP1 BRD9 敲除 #HZGHC000934c003;HAP1 BRD7 敲除 #HZGHC000923c010;HAP1 BRD2 敲除 #HZGHC000356c015;HAP1 BRD3 敲除 #HZGHC000244c004;HAP1 BRD4 敲除 #HZGHC000937c007。


使用敲除 HAP1 细胞系验证总 BRD7 检测的特异性

HTRF 总 BRD7 检测与蛋白质印迹法的比较

将 MCF7 细胞在 T175 培养瓶中的完全培养基中于 37°C、5% CO₂条件下培养。孵育 48 小时后,移除细胞培养基,用 3mL 补充的 4 号裂解缓冲液(1X)在室温下轻轻振荡裂解细胞 30 分钟。


用补充的 4 号裂解缓冲液对细胞裂解物进行系列稀释,将 16µL 各稀释液转移至小体积白色微孔板中,然后加入 4µL HTRF 总 BRD7 检测试剂。


使用等量的裂解物进行 HTRF 和蛋白质印迹法的平行比较。


在此条件下,HTRF 总 BRD7 检测的灵敏度是蛋白质印迹法的 8 倍。


HTRF 总 BRD7 检测与蛋白质印迹法的比较

简化通路

BRD7 信号通路
含溴结构域蛋白 7(BRD7)是 IV 类溴结构域含蛋白质家族的成员。已有报道称,BRD7 在某些癌症(如上皮性卵巢癌、乳腺癌、鼻咽癌和结直肠癌)中表达下调。


BRD7 与 p110/p85 的相互作用竞争,并促进 p85 的核转位,通过其调节 X 盒结合蛋白 1(XBP1)核转位的能力,实现未折叠蛋白反应(UPR)信号传导。


依赖 BRD7 的细胞质中 p85 耗竭会阻碍 PI3 激酶复合体的形成,导致 PI3K 活性降低。因此,BRD7 间接下调了一个参与多种癌症相关过程(包括细胞凋亡、蛋白质合成、增殖和血管生成)的关键通路。


pathway-BRD7-total.svg(BRD7 通路图)

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