SMARCA 基因亚组属于 SWI/SNF 家族,参与染色质重塑和 DNA 损伤修复。SWI/SNF 复合体调控涉及 DNA 复制、损伤修复和细胞增殖等基本过程的基因。
SMARCA4/BRG1 和 SMARCA2/BRM 是 SWI/SNF 复合体中两个互斥的催化性 ATP 酶亚基。
SMARCA4 功能缺失常与癌症相关,且在 SMARCA4 缺陷型癌症中,SMARCA4 和 SMARCA2 之间的合成致死关系已得到充分证实 —— 在这种情况下,SMARCA2 的失活会导致肿瘤细胞死亡。
在正在研究的抗癌治疗策略中,靶向蛋白降解有望克服传统小分子药物的一些局限性。迄今为止,已开发出 PROTAC 分子来诱导 SMARCA 蛋白的选择性降解。然而,SMARCA2 和 SMARCA4 在蛋白质水平上有约 75% 的同源性,因此化合物可能会同时靶向这两种蛋白质。因此,必须仔细研究靶向 SMARCA2 或 SMARCA4 的化合物的选择性。在这类研究中,HTRF 总 SMARCA4 检测试剂盒是 HTRF 总 SMARCA2 检测试剂盒的重要配套检测工具,可实现可靠的化合物分析。
HTRF 总 SMARCA2 检测可定量细胞裂解物中 SMARCA2 的表达水平。与蛋白质印迹法(Western Blot)不同,该检测完全基于微孔板,无需凝胶、电泳或转膜步骤。总 SMARCA2 检测使用两种标记抗体:一种与供体荧光团偶联,另一种与受体荧光团偶联。两种抗体都对该蛋白质上的特定表位具有高度特异性。当细胞提取物中存在 SMARCA2 时,添加这些偶联物会使供体荧光团与受体荧光团接近,从而产生 FRET 信号。其强度与样品中蛋白质的浓度直接成正比,并提供了一种在无需洗涤的检测格式中评估蛋白质表达的方法。
双板方案包括在 96 孔板中培养细胞,裂解后将裂解物转移到 384 孔小体积检测板中,然后添加总 SMARCA2 HTRF 检测试剂。该方案能够监测细胞活力和汇合度。
总 SMARCA2 单板检测方案
使用 HTRF 试剂检测总 SMARCA2 可在单个用于培养、刺激和裂解的板中进行,无需洗涤步骤。这种为高通量筛选(HTS)设计的方案能够实现微型化,同时保持稳定的 HTRF 质量。
使用 HTRF 总 SMARCA2 试剂盒评估 A549(肺癌)和 HAP1 细胞(野生型,WT)中 SMARCA2 的表达水平。同时,使用 HTRF 总 SMARCA4 试剂盒评估 SMARCA4 的表达水平。事先对细胞密度进行了优化,以确保 HTRF 检测在试剂盒的动态范围内(数据未显示)。
将不同的细胞系接种在 96 孔培养板中,密度为 200,000 个细胞 / 孔,并在 37°C、5% CO₂条件下孵育 24 小时。去除培养基后,用 50 µL 补充的 1X 裂解缓冲液 #1 在室温下轻轻振荡裂解细胞 30 分钟。然后将 16 µL 细胞裂解物转移到小体积白色微孔板中,随后加入 4 µL 预混合的检测试剂。在室温下孵育过夜后记录 HTRF 信号。
在 A549 细胞中检测到 SMARCA2 的低表达,而 SMARCA4 的表达与非特异性信号(虚线)相当,这表明 SMARCA4 缺乏表达,正如文献(Hoffman, G. R. 等人,《美国国家科学院院刊》,2014 年)所描述的那样。
此外,HAP1 细胞中 SMARCA2 的表达水平与非特异性信号(虚线)相当,表明 SMARCA2 缺乏表达,而正如预期的那样,在 HAP1 细胞中可很好地检测到 SMARCA4 的水平。
这些结果证明,尽管 SMARCA2 和 SMARCA4 这两种蛋白质具有超过 70% 的序列同源性,但 HTRF SMARCA2 试剂盒对 SMARCA4 具有特异性。
细胞系参考目录(Horizon Discovery):HAP1 野生型 #C631。
将贴壁人类细胞系 HeLa(宫颈)、HEK293(肾脏)和 A549(肺癌)接种在 96 孔培养板中,密度为 200,000 个细胞 / 孔,并在 37°C、5% CO₂条件下孵育 24 小时。去除培养基后,用 50 µL 补充的 1X 裂解缓冲液 #1 在室温下轻轻振荡裂解细胞 30 分钟。
将悬浮人类细胞系 HEL92.1.7(红白血病)和 MOLT-4(T 淋巴母细胞白血病)以 30 µL 的体积接种到 96 孔板中,密度为 200,000 个细胞 / 孔,在 37°C、5% CO₂条件下孵育 1 小时,然后用 10 µL 补充的 4X 裂解缓冲液 #1 在室温下轻轻振荡裂解 30 分钟。
使用 HTRF 总 SMARCA2 试剂盒评估 SMARCA2 的表达水平。简要步骤为:将 16 µL 细胞裂解物转移到小体积白色微孔板中,然后加入 4 µL 预混合的 HTRF 检测试剂。在室温下孵育过夜后记录 HTRF 信号。虚线对应非特异性 HTRF 信号。请注意,事先对细胞密度进行了优化,以确保 HTRF 检测在试剂盒的动态范围内(数据未显示)。
HTRF 总 SMARCA2 检测能有效检测各种表达不同水平该蛋白质的细胞模型中的内源性 SMARCA2。
将 HEL92.1.7 细胞接种在 96 孔板中(100,000 个细胞 / 30µL 孔),并用不同浓度的 PROTAC® 化合物 ACBI1 和 AU-15330 处理,同时使用 PROTAC ARV-471(PROTAC® 雌激素受体)作为阴性无关对照。孵育过夜后,用 10 µL 补充的 4X 裂解缓冲液 #1 在室温下轻轻振荡裂解细胞 30 分钟。细胞裂解后,将 16 µL 裂解物转移到 384 孔小体积白色微孔板中,并加入 4 µL HTRF 总 SMARCA2 检测抗体。孵育过夜后记录 HTRF 信号。
用两种 SMARCA2 PROTAC® 降解剂处理细胞后,SMARCA2 蛋白呈剂量依赖性减少,而在 ARV-471 对照条件下,SMARCA2 的表达水平以及 ATP 水平保持稳定。这些结果表明 PROTAC® 诱导了特异性的 SMARCA2 降解,其 DC50 * 在纳摩尔范围内,与预期一致(Farnabay, W. 等人,《自然化学生物学》,2019 年;Xiao, L. 等人,《自然》,2022 年)。
*DC50 指降解剂使 50% 的靶蛋白降解时的浓度。
将 HEL92.1.7 细胞接种在 96 孔板中(100,000 个细胞 / 30µL 孔),并用不同浓度的 PROTAC® 化合物 ACBI1 和 AU-15330 处理。孵育过夜后,用 10 µL 补充的 4X 裂解缓冲液 #1 在室温下轻轻振荡裂解细胞 30 分钟。细胞裂解后,将 16 µL 裂解物转移到 384 孔小体积白色微孔板中,并加入 4 µL HTRF 检测抗体,使用总 SMARCA2 或总 SMARCA4 检测试剂。孵育过夜后记录 HTRF 信号。
结果表明,ACBI1 和 AU-15330 诱导 SMARCA2 和 SMARCA4 呈剂量依赖性减少。在相同条件下,ATP 水平保持稳定(数据未显示)。这些结果与 Farnabay, W. 等人(《自然化学生物学》,2019 年)和 Xiao, L. 等人(《自然》,2022 年)的研究一致。
在含完全培养基的 T175 培养瓶中培养 HEL92.1.7 细胞,置于 37°C、5% CO₂条件下。孵育 24 小时后去除细胞培养基,用 3 mL 补充的 1X 裂解缓冲液 #1 在室温下轻轻振荡裂解细胞 30 分钟。
使用补充的裂解缓冲液 #1 对细胞裂解物进行系列稀释,将 16 µL 每种稀释液转移到小体积白色微孔板中,然后加入 4 µL HTRF 总 SMARCA2 检测试剂。
使用等量的裂解物进行 HTRF 和蛋白质印迹法的平行比较。
在这些条件下,HTRF 总 SMARCA2 检测与蛋白质印迹法具有同等的灵敏度。
SMARCA2 和 SMARCA4 是 SWI/SNF 复合体中的催化亚基,参与 DNA 转录和修复。SMARCA2 和 SMARCA4 包含 6 个不同的结构域,包括 DNA 依赖性 ATP 酶结构域和溴结构域(Bromo domain)。溴结构域和 H3K27 乙酰化水平调控 DNA 与 SWI/SNF 复合体之间的结合,而 ATP 酶结构域催化两条 DNA 链的分离。这些功能被 PRC2 复合体的 EZH2 催化亚基所拮抗,EZH2 会抑制基因转录。SMARCA2 或 SMARCA4 的功能缺失会导致 DNA 损伤增加,因为 PRC2 会继续与核小体结合并抑制 DNA 修复。
- 应用领域:细胞信号传导
- 品牌:HTRF
- 检测方式:HTRF
- 兼容的裂解缓冲液:裂解缓冲液 1、裂解缓冲液 2、裂解缓冲液 4
- 分子修饰:总(蛋白)
- 产品类别:试剂盒
- 样品体积:16 µL
- 运输条件:干冰运输
- 靶标类别:磷酸化蛋白
- 靶标物种:人类
- 技术:时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)
- 单位规格:500 个检测点